Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA1SQ13698 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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