Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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CUL3Q13618 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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