Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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