Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACADSBP45954 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACADSBP45954 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms