Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MLH1P40692 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MLH1P40692 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MLH1P40692 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms