Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CASP1P29466 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP1P29466 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP1P29466 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms