Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms