Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C4orf47A7E2U8 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C4orf47A7E2U8 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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