Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF24Q9UPV7 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms