Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
XCL2Q9UBD3 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms