Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
DPM3Q9P2X0 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms