Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms