Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CRACR2AQ9BSW2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRACR2AQ9BSW2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms