Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HERC6Q8IVU3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HERC6Q8IVU3 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms