Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APTXQ7Z2E3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APTXQ7Z2E3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms