Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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