Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AL606970.2-201ENST00000434596 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ADPGK-202ENST00000456471 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GAPVD1Q14C86 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms