Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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