Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABPAQ06546 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.7 ms