Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK8P49336 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms