Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SSR3-202ENST00000463503 596 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC096919.1-201ENST00000472730 652 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LANCL1-203ENST00000431941 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AP003392.3-201ENST00000531886 667 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 ALDOAP2-201ENST00000398050 1076 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRXP46100 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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