Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNFSF9P41273 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFSF9P41273 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms