Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC015802.4-203ENST00000592622 570 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RN7SL229P-201ENST00000495651 299 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AP005264.6-203ENST00000586882 1050 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 GAPDHP76-201ENST00000512278 976 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MUTYH-236ENST00000529984 1029 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MED20-204ENST00000409312 932 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRMP28827 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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