Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATF3P18847 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATF3P18847 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms