Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFTRP13569 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 C8orf37-AS1-203ENST00000521905 617 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CFTRP13569 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms