Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYP2C9P11712 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms