Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HMGB1P1B2RPK0 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms