Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CTNNBIP1Q9NSA3 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms