Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PFDN4Q9NQP4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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PFDN4Q9NQP4 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PFDN4Q9NQP4 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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