Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CELF4Q9BZC1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CELF4Q9BZC1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms