Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LMO3Q8TAP4 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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