Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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RNF182Q8N6D2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RNF182Q8N6D2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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