Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMED8Q6PL24 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms