Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q6P435 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q6P435 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q6P435 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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