Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms