Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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