Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTCH1Q13635 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTCH1Q13635 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTCH1Q13635 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTCH1Q13635 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTCH1Q13635 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTCH1Q13635 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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