Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SSBP1Q04837 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms