Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LMO4P61968 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms