Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMARCA4P51532 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL161644.1-201ENST00000426901 1111 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMARCA4P51532 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms