Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNA2P51530 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNA2P51530 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNA2P51530 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms