Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GTF2H1P32780 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GTF2H1P32780 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GTF2H1P32780 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms