Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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OTX2P32243 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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OTX2P32243 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OTX2P32243 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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OTX2P32243 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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OTX2P32243 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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OTX2P32243 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
OTX2P32243 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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