Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GJB2P29033 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GJB2P29033 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms