Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYT1P21579 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYT1P21579 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms