Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC9A1P19634 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms