Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXD8P13378 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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