Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC192P0DO97 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms