Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FAM58BPP0C7Q3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms