Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SMIM1B2RUZ4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms